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É situação comum desconhecer-se o grau de parentesco entre a população na origem da maioria dos programas de melhoramento genético de espécies florestais. Para resolver este problema, desenvolvemos um protocolo de avaliação do parentesco utilizando 125 indivíduos e 16 microssatélites, da população base ou de referência (PR) de Eucalyptus globulus do RAIZ. Através da recombinação gamética in silico foram simulados 105 indivíduos com diferentes graus de parentesco: descendentes de autopolinização, meiosirmãos, irmãos completos e indivíduos não aparentados. Por simulação Monte-Carlo foram calculados o valor médio e a variância associada à média dos diferentes grupos de parentesco, com quatro coeficientes de similaridade genética. Compararam-se as funções densidade dos diferentes grupos de parentesco, obtidas com quatro coeficientes de parentesco, utilizando o valor crítico correspondente à intercepção das funções densidade dos indivíduos não aparentados e dos meios-irmãos. O estimador escolhido foi aplicado à PR. Detectaram-se 4,4% de pares de indivíduos potencialmente aparentados, com um erro de tipo II de 8%. Inferimos também, o parentesco de um conjunto de 24 clones elite e encontrámos 4 pares que são potencialmente aparentados. Futuros cruzamentos entre estes indivíduos deverão ser evitados.
In this study we have analyzed the information provided by 17 publicly available Eucalyptus microsatellite (SSR) markers (Brondani et al. 1998, 2002; Jones et al. 2002; Steane et al. 2001) in the context of genetic identification within a sample of 140 individuals from an elite collection (denoted hereafter base) of RAIZ genetic improvement population.
The base populations used in most forest tree genetic improvement programs usually lack detailed pedigree information. Molecular markers, such as microsatellites (SSR), can be used to estimate individuals’ pairwise relatedness, which is based on the probabilities’ ratios of the identity in state between the individuals compared and the reference unrelated population These estimates can be very useful to infer the level of relationship among sub-populations of elite material and/or for the design of controlled crosses between putatively unrelated parents. Using 113 putatively unrelated individuals - genotyped with 18 SSR - self, full-sib, half-sib and unrelated were simulated, and four pairwise similarity coefficients were tested: Queller & Goodnight 1989; Li et al. 1993; Ritland 1996, and Lynch & Ritland 1999. The Lynch & Ritland (1999) coefficient was selected (Figure 1), for it displayed a better adjustment with the expected level of relatedness and narrower standard errors (SE). SE were calculated through Monte- Carlo techniques, to avoid unequal sample size bias, by using 105 simulations for each relatedness group. To illustrate the usefulness of molecular estimates of similarity in genetic improvement programs, a clustering (UPGMA) based on the pairwise Lynch & Ritland (1999) coefficient (LR) values was performed to infer about the putative relationship among individuals of the subgroups of E. globulus elite individuals. From that analysis at least two pairs might be related and a PCA analysis confirmed the clustering results.